Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WUJ7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WUJ7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A087WUJ7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A087WUJ7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A087WUJ7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A087WUJ7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A087WUJ7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A087WUJ7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A087WUJ7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A087WUJ7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A087WUJ7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A087WUJ7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A087WUJ7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A087WUJ7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A087WUJ7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A087WUJ7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A087WUJ7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A087WUJ7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A087WUJ7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A087WUJ7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A087WUJ7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A087WUJ7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A087WUJ7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A087WUJ7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A087WUJ7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A087WUJ7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A087WUJ7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A087WUJ7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A087WUJ7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A087WUJ7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A087WUJ7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A087WUJ7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A087WUJ7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A087WUJ7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A087WUJ7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A087WUJ7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A087WUJ7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A087WUJ7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A087WUJ7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A087WUJ7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A087WUJ7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A087WUJ7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A087WUJ7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A087WUJ7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A087WUJ7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A087WUJ7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A087WUJ7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A087WUJ7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A087WUJ7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A087WUJ7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A087WUJ7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A087WUJ7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A087WUJ7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A087WUJ7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A087WUJ7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A087WUJ7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A087WUJ7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A087WUJ7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A087WUJ7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A087WUJ7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A087WUJ7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A087WUJ7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A087WUJ7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A087WUJ7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A087WUJ7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A087WUJ7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A087WUJ7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A087WUJ7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A087WUJ7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A087WUJ7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A087WUJ7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A087WUJ7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A087WUJ7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
A0A087WUJ7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A087WUJ7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A087WUJ7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A087WUJ7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A087WUJ7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A087WUJ7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A087WUJ7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A087WUJ7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A087WUJ7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A087WUJ7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A087WUJ7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A087WUJ7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A087WUJ7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A087WUJ7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A087WUJ7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A087WUJ7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A087WUJ7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A087WUJ7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
A0A087WUJ7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A087WUJ7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A087WUJ7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A087WUJ7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A087WUJ7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A087WUJ7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A087WUJ7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A087WUJ7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A087WUJ7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A087WUJ7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms