Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 TRMT10A-202ENST00000394876 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 CPB1-201ENST00000282957 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 LINC01362-202ENST00000452901 1712 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AL136298.2-201ENST00000556497 1570 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 TMEM59-204ENST00000371344 2473 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 PWRN1-212ENST00000569908 1435 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 REG1A-201ENST00000233735 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 OR4M1-201ENST00000315957 1116 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 OR51H1-201ENST00000322059 999 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 CES5AP1-201ENST00000400418 859 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 RFKP1-201ENST00000400940 428 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 OR7E117P-201ENST00000422682 1112 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AC011753.2-201ENST00000425576 610 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AC079781.1-201ENST00000441505 394 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 HNRNPDLP2-201ENST00000455248 751 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 RPS18P13-201ENST00000461260 454 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 RPL12P5-201ENST00000475149 392 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 RPL23AP8-201ENST00000479812 475 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 RN7SL561P-201ENST00000488553 281 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AC008417.1-201ENST00000510014 565 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AC122713.1-201ENST00000518368 1015 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AC084816.1-211ENST00000540994 485 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AL132719.1-201ENST00000554515 423 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AC018521.6-201ENST00000584276 335 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AC108451.2-201ENST00000603875 538 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AL136141.1-201ENST00000605780 369 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 Metazoa_SRP.180-201ENST00000612546 322 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 LINC01742-201ENST00000616333 628 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 BX005195.1-201ENST00000618097 1198 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 CASP10-203ENST00000313728 1521 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 GNRH1-201ENST00000276414 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 R3HCC1L-206ENST00000613938 1397 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 ADAMTS9-AS2-203ENST00000481312 1970 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 MRPS31-201ENST00000323563 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AL606490.2-201ENST00000457562 1330 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 OR8B8-202ENST00000642064 3914 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AC015969.1-201ENST00000366218 1416 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 MOB4-201ENST00000233892 3785 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AF064860.2-201ENST00000457325 1542 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 CDH19-203ENST00000540086 1963 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 IFT43-201ENST00000238628 816 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 RPL24P4-201ENST00000326586 421 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP260-201ENST00000363849 111 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 MED15P8-201ENST00000411601 545 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 VAV3-203ENST00000415432 1293 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AC007422.2-201ENST00000419809 167 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AL627308.2-201ENST00000420014 432 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AC092568.1-201ENST00000440950 1284 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AL136982.6-201ENST00000444180 1238 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 PTPN20-219ENST00000508602 742 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 PTPN20-221ENST00000509599 945 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 PTPN20-223ENST00000509900 693 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 PTPN20-228ENST00000513266 818 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 CRYAB-203ENST00000525823 915 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AP006587.5-201ENST00000532033 739 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 SOX5-213ENST00000541847 758 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 PPIAL4D-201ENST00000544708 495 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AC034102.7-201ENST00000550840 470 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AL034376.2-201ENST00000568110 573 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AC027688.2-201ENST00000569009 511 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 RN7SL199P-201ENST00000578752 281 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 RN7SL656P-201ENST00000579044 281 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 RN7SL404P-201ENST00000582421 281 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 LINC01255-203ENST00000587189 591 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 EIF1-207ENST00000591776 797 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 OR7A11P-201ENST00000597719 953 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 EDRF1-AS1-205ENST00000601363 712 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AL953862.2-201ENST00000603089 820 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 Metazoa_SRP.124-201ENST00000610352 345 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AC135050.6-202ENST00000613584 392 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
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