Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 POF1B-202ENST00000373145 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 NRXN3-203ENST00000428277 4219 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 LINC00208-201ENST00000304233 2150 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 NAT1-206ENST00000518029 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 AC021078.1-201ENST00000499521 8636 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 DAZ2-206ENST00000382440 4119 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 CEACAM5-203ENST00000405816 2354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 NPL-212ENST00000614468 2376 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 PKIA-AS1-202ENST00000522302 2011 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 ZRANB3-202ENST00000401392 6820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 MDM4-214ENST00000612738 9407 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 CCR6-202ENST00000349984 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 SLC26A5-206ENST00000393727 2270 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 HERC4-211ENST00000492996 3385 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 UBE2V1-204ENST00000371677 2459 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 PMCHL2-202ENST00000450213 1917 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 NPIPB4-203ENST00000415645 3606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 OR3A3-203ENST00000641141 3800 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 HLTF-203ENST00000465259 5306 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 LIPA-203ENST00000371837 2513 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 ANKS1B-211ENST00000547776 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 ST7-206ENST00000393447 2182 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 CCDC77-201ENST00000239830 2371 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 ITPR1-204ENST00000443694 9513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 RNU6-1017P-201ENST00000363613 106 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 AL137058.2-203ENST00000398039 825 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 ATP6V1E1-203ENST00000399798 994 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 AC016716.2-201ENST00000418621 486 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 GAPDHP20-201ENST00000444107 1007 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 AC010878.1-201ENST00000456500 1047 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 AL138787.2-201ENST00000466576 367 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 PSMA6-204ENST00000553809 879 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 AC040162.2-201ENST00000573092 157 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 PPIAP14-201ENST00000577627 496 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 AC096708.2-201ENST00000577676 512 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 RN7SL178P-201ENST00000582930 304 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 AC068418.1-201ENST00000582990 404 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 RPS11-202ENST00000594493 575 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 AL049767.1-201ENST00000636811 514 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 ZNF812P-201ENST00000457674 1694 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 SLC35A3-207ENST00000533028 14759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 AL355974.1-201ENST00000618896 1708 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 AL512624.2-201ENST00000621705 2566 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 ZNF532-223ENST00000591230 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 ATP5BP1-201ENST00000411980 1574 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 SLC16A4-206ENST00000472422 2420 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 CTNNA2-202ENST00000361291 3071 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 CYB5D1-201ENST00000332439 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 TMEM99-204ENST00000622451 2073 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 PPP6R3-206ENST00000524904 4292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 CXCR2P1-201ENST00000439871 2503 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 NR3C2-207ENST00000511528 2967 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 CRYZ-201ENST00000340866 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 REG4-203ENST00000369401 2327 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 KIAA0391-201ENST00000250377 6118 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 RBM46-201ENST00000281722 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 DCP2-201ENST00000389063 8947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
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HOXD10P28358 Z97832.2-201ENST00000605896 4261 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
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HOXD10P28358 AC096741.2-201ENST00000510225 637 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 MAPK10-223ENST00000511167 1265 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 RNA5SP278-201ENST00000517055 102 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 MT1B-202ENST00000562399 351 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 LINC01919-201ENST00000578610 568 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 CLCN5-201ENST00000307367 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 ZMYND11-202ENST00000381584 2709 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 PDE4B-207ENST00000480109 2037 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 ITPR1-203ENST00000357086 9762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 APP-209ENST00000440126 2846 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 SCG3-201ENST00000220478 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 LINC00294-201ENST00000631190 3306 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 ANGEL2-201ENST00000360506 4323 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 GABRA6-201ENST00000274545 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 LRRTM3-201ENST00000361320 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 ZNF814-201ENST00000435989 3146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 TSC22D1-212ENST00000611198 2877 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 GAGE1-204ENST00000619375 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
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