Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
COG3Q96JB2 AC068726.1-201ENST00000610993 341 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
COG3Q96JB2 ARMC3-203ENST00000409049 2479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
COG3Q96JB2 ZNF426-201ENST00000253115 7085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
COG3Q96JB2 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
COG3Q96JB2 NXPE3-203ENST00000477909 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
COG3Q96JB2 RBFOX2-205ENST00000405409 6932 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
COG3Q96JB2 NF1P8-201ENST00000415351 1461 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
COG3Q96JB2 FAM49B-226ENST00000523509 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
COG3Q96JB2 PSEN1-201ENST00000324501 6078 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
COG3Q96JB2 ZIM3-201ENST00000269834 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
COG3Q96JB2 AC018992.1-201ENST00000523778 2149 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
COG3Q96JB2 OR2A42-202ENST00000641810 4946 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
COG3Q96JB2 ZDBF2-201ENST00000374423 10286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
COG3Q96JB2 XAGE3-201ENST00000346279 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
COG3Q96JB2 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
COG3Q96JB2 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
COG3Q96JB2 CD33-203ENST00000421133 1023 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
COG3Q96JB2 AC068888.2-201ENST00000435621 536 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
COG3Q96JB2 AL035420.1-202ENST00000450129 357 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
COG3Q96JB2 VNN3-210ENST00000450865 596 ntTSL 4 BASIC9.28□□□□□ -0.92
COG3Q96JB2 ATP6V0E1-202ENST00000517669 502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
COG3Q96JB2 SNRPCP6-201ENST00000528310 210 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
COG3Q96JB2 AC011603.2-202ENST00000552893 504 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
COG3Q96JB2 AC005519.1-201ENST00000554490 601 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
COG3Q96JB2 AC040963.1-201ENST00000591900 564 ntTSL 4 BASIC9.28□□□□□ -0.92
COG3Q96JB2 AL596275.2-203ENST00000641951 371 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
COG3Q96JB2 KIAA1549L-201ENST00000265654 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
COG3Q96JB2 ANKRD36BP2-207ENST00000622311 5398 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
COG3Q96JB2 USP16-203ENST00000399975 2960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
COG3Q96JB2 MAPRE2-203ENST00000436190 4323 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
COG3Q96JB2 UBAP2-201ENST00000360802 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
COG3Q96JB2 ADGRG7-201ENST00000273352 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
COG3Q96JB2 SIPA1L1-201ENST00000358550 6539 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.92
COG3Q96JB2 TTC21A-203ENST00000431162 4209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
COG3Q96JB2 MAPK6-201ENST00000261845 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
COG3Q96JB2 TRAF5-202ENST00000336184 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
COG3Q96JB2 IMPG1-201ENST00000369950 3558 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
COG3Q96JB2 BCL2L14-211ENST00000586576 1927 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
COG3Q96JB2 OR9I1-203ENST00000641478 3027 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.93
COG3Q96JB2 C5orf24-201ENST00000338051 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
COG3Q96JB2 AC009264.1-207ENST00000425981 1538 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
COG3Q96JB2 EIF4E2-207ENST00000409514 3525 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
COG3Q96JB2 CARF-202ENST00000402905 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
COG3Q96JB2 ENSA-201ENST00000271690 2818 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
COG3Q96JB2 GANC-201ENST00000318010 7781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
COG3Q96JB2 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
COG3Q96JB2 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
COG3Q96JB2 OR13F1-201ENST00000334726 960 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.93
COG3Q96JB2 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
COG3Q96JB2 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
COG3Q96JB2 RN7SKP250-201ENST00000363924 321 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
COG3Q96JB2 IGKV3-7-201ENST00000390247 445 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.93
COG3Q96JB2 IGHV6-1-201ENST00000390593 415 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.93
COG3Q96JB2 RNA5SP474-201ENST00000391234 90 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
COG3Q96JB2 AC245036.1-201ENST00000391727 309 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
COG3Q96JB2 GAPDHP57-201ENST00000424400 585 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
COG3Q96JB2 LINC00575-201ENST00000426551 910 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
COG3Q96JB2 AL445218.1-202ENST00000427695 845 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
COG3Q96JB2 OR1M1-201ENST00000429566 1035 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.93
COG3Q96JB2 BMP6P1-201ENST00000431230 679 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
COG3Q96JB2 GAPDHP37-201ENST00000442317 968 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
COG3Q96JB2 AC135721.2-201ENST00000464237 300 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
COG3Q96JB2 GPX6-202ENST00000474923 716 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
COG3Q96JB2 AC104078.2-201ENST00000504344 541 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
COG3Q96JB2 AC026774.2-201ENST00000513990 1098 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
COG3Q96JB2 EEF1B2P2-201ENST00000519625 676 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
COG3Q96JB2 TMEM116-208ENST00000549537 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
COG3Q96JB2 AL390718.1-201ENST00000566904 506 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
COG3Q96JB2 MDFIC2-201ENST00000567252 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
COG3Q96JB2 NDUFB9P1-201ENST00000604683 510 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
COG3Q96JB2 HNRNPA3P9-201ENST00000604913 979 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
COG3Q96JB2 SNORA16A-202ENST00000628458 135 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
COG3Q96JB2 SLC12A1-202ENST00000380993 4707 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
COG3Q96JB2 CD46-204ENST00000357714 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
COG3Q96JB2 TLR10-204ENST00000506111 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
COG3Q96JB2 MPP7-201ENST00000337532 5080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
COG3Q96JB2 DIS3-201ENST00000377767 10604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
COG3Q96JB2 LRRTM3-201ENST00000361320 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
COG3Q96JB2 GPCPD1-201ENST00000379019 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
COG3Q96JB2 ITPR1-203ENST00000357086 9762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
COG3Q96JB2 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
COG3Q96JB2 MAPK10-379ENST00000642013 1385 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
COG3Q96JB2 NEUROD4-201ENST00000242994 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
COG3Q96JB2 KIAA0391-201ENST00000250377 6118 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
COG3Q96JB2 ROR1-AS1-201ENST00000412349 1574 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
COG3Q96JB2 CYP4A22-206ENST00000619754 2351 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
COG3Q96JB2 PLGLB2-201ENST00000359481 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
COG3Q96JB2 PSMD10-206ENST00000372296 878 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
COG3Q96JB2 CD209-205ENST00000394161 507 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
COG3Q96JB2 RPL12P23-201ENST00000405880 490 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
COG3Q96JB2 RN7SKP232-201ENST00000410170 290 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
COG3Q96JB2 AL121823.1-201ENST00000418369 741 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
COG3Q96JB2 LINC00433-201ENST00000424165 888 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
COG3Q96JB2 E2F3-IT1-201ENST00000433182 400 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
COG3Q96JB2 LINC00328-2P-201ENST00000436585 219 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
COG3Q96JB2 AL138767.3-201ENST00000438082 495 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
COG3Q96JB2 AC092164.1-203ENST00000444501 723 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
COG3Q96JB2 LINC01487-201ENST00000462531 905 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
COG3Q96JB2 PRICKLE2-AS2-201ENST00000484703 496 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.2 ms