Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 LINC01098-201ENST00000507870 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 AL390198.2-201ENST00000510553 222 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 SMIM20-202ENST00000514384 774 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 AC135178.4-201ENST00000585275 548 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 AL513478.2-201ENST00000610400 988 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 AC068726.1-201ENST00000610993 341 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 FGD6-205ENST00000549499 3757 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 AP005139.1-201ENST00000580702 1647 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 AC243772.3-201ENST00000617878 1537 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 TLR7-201ENST00000380659 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 EIF4ENIF1-205ENST00000397523 3420 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 NEDD4L-207ENST00000435432 3417 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 OR2A5-202ENST00000641693 8681 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 DEFB132-201ENST00000382376 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 LINC01441-201ENST00000433766 2290 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 DIO2-201ENST00000422005 6272 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 LRRC37A15P-201ENST00000514785 1355 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 FBXO43-201ENST00000428847 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 AC121758.1-201ENST00000557452 3942 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 NUDT5-203ENST00000378940 1126 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 GNAT3-201ENST00000398291 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 AL033519.1-201ENST00000407266 307 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 CYCSP17-201ENST00000407870 315 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 RPL31-202ENST00000409000 641 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 ARMC4P1-201ENST00000438905 707 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 GAPDHP33-201ENST00000443168 1013 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 AL035443.1-201ENST00000456631 304 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 RN7SL382P-201ENST00000482631 282 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 AC093870.1-201ENST00000506837 213 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 AC022784.1-201ENST00000512942 699 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 LINC02482-202ENST00000515205 422 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 AC008708.1-201ENST00000517346 474 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 CRYZ-201ENST00000340866 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 AF064860.2-201ENST00000457325 1542 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 COPS4-209ENST00000511653 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 WDR48-201ENST00000302313 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 GDPD4-201ENST00000315938 2533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 KLHL3-209ENST00000508657 6981 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 PGR-202ENST00000325455 13748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 RIPOR2-208ENST00000613507 5539 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 CA1-222ENST00000523953 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 INTS7-203ENST00000366994 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 NEK5-201ENST00000355568 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
VPS8Q8N3P4 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
VPS8Q8N3P4 VIM2P-201ENST00000402383 1294 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
VPS8Q8N3P4 AF274855.1-201ENST00000411474 850 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPS8Q8N3P4 AC118754.1-201ENST00000416958 370 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPS8Q8N3P4 RPEP4-201ENST00000437636 602 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
VPS8Q8N3P4 AL390728.3-201ENST00000452704 270 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
VPS8Q8N3P4 RPL7AP23-201ENST00000482625 776 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
VPS8Q8N3P4 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPS8Q8N3P4 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPS8Q8N3P4 AC008443.6-204ENST00000511517 738 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPS8Q8N3P4 AC026956.1-201ENST00000558741 396 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
VPS8Q8N3P4 AC040963.1-201ENST00000591900 564 ntTSL 4 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPS8Q8N3P4 OR1N1-202ENST00000619659 939 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
VPS8Q8N3P4 LINC00836-201ENST00000625325 582 ntTSL 4 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPS8Q8N3P4 RAB11A-201ENST00000261890 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPS8Q8N3P4 AL136317.2-201ENST00000619851 2254 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPS8Q8N3P4 WDR93-204ENST00000558000 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPS8Q8N3P4 CACNB4-254ENST00000637514 1880 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPS8Q8N3P4 COL6A4P1-202ENST00000487147 4317 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
VPS8Q8N3P4 FGF10-201ENST00000264664 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPS8Q8N3P4 GUCY2C-201ENST00000261170 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPS8Q8N3P4 NRXN3-201ENST00000281127 8504 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPS8Q8N3P4 AC006019.2-201ENST00000451116 3044 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPS8Q8N3P4 NUMB-203ENST00000359560 3309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPS8Q8N3P4 XIAP-201ENST00000355640 8584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPS8Q8N3P4 ANKRD44-202ENST00000328737 3686 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPS8Q8N3P4 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPS8Q8N3P4 AC011753.2-201ENST00000425576 610 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPS8Q8N3P4 AC128677.1-201ENST00000436016 442 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
VPS8Q8N3P4 FBXW12-203ENST00000436231 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPS8Q8N3P4 ZNF331-203ENST00000449416 3817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPS8Q8N3P4 AC133965.1-201ENST00000452984 354 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
VPS8Q8N3P4 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
VPS8Q8N3P4 AC138517.1-201ENST00000515724 568 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
VPS8Q8N3P4 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
VPS8Q8N3P4 OPCML-IT2-201ENST00000533260 398 ntTSL 4 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPS8Q8N3P4 AP003115.1-201ENST00000569849 463 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
VPS8Q8N3P4 AC011921.2-201ENST00000589465 152 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
VPS8Q8N3P4 AC093635.1-201ENST00000609028 555 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
VPS8Q8N3P4 GAPDHP41-201ENST00000613707 975 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
VPS8Q8N3P4 LINC01011-204ENST00000605901 1573 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
VPS8Q8N3P4 TRIM6-TRIM34-201ENST00000354852 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
VPS8Q8N3P4 ZC3H11B-202ENST00000636126 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
VPS8Q8N3P4 B4GALT4-207ENST00000467604 5794 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VPS8Q8N3P4 CXCR6-204ENST00000458629 2805 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
VPS8Q8N3P4 COG2-209ENST00000534989 2963 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
VPS8Q8N3P4 STK4-207ENST00000499879 6161 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VPS8Q8N3P4 CAGE1-203ENST00000379918 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
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