Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 CAST-202ENST00000325674 3356 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 ENO1P4-201ENST00000416471 1785 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 COLCA1-205ENST00000620864 8098 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 CAPS2-205ENST00000409445 2135 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 SSX7-201ENST00000298181 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 ABCD3-202ENST00000370214 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 ASAH1-267ENST00000637991 2399 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 ARHGAP32-203ENST00000524655 8194 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 BROX-201ENST00000340934 4124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 ANKS4B-201ENST00000311620 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 UNC13B-210ENST00000636694 8012 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 AC009237.3-203ENST00000442128 3551 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 HDAC9-214ENST00000441542 3210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 SETDB1-201ENST00000271640 4437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 GKN2-202ENST00000481498 1498 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 AF131216.1-201ENST00000498997 5856 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 KLF7-201ENST00000309446 8362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 ALS2CR12-207ENST00000439709 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 UGT3A1-207ENST00000625798 3097 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 SUPT20H-224ENST00000542180 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 XAGE5-202ENST00000375501 415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 PPIAP26-201ENST00000377951 522 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 IL20-203ENST00000391930 1153 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 RN7SKP137-201ENST00000411074 307 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 AC007349.3-201ENST00000415356 872 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 AC008753.1-201ENST00000423096 284 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 SNX19-202ENST00000426933 888 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 CEACAMP5-201ENST00000448037 961 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 AC006026.3-201ENST00000454029 143 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 C2orf74-204ENST00000464909 726 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 ZNF138-207ENST00000494380 842 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 AC002401.2-201ENST00000511361 430 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 AC087672.3-201ENST00000519323 738 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 C8orf44-205ENST00000521889 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 AL135978.1-201ENST00000553618 1266 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 PSMA6-204ENST00000553809 879 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 PSMA6-214ENST00000556506 763 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 AL132640.1-201ENST00000559594 619 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 RN7SL366P-201ENST00000577957 292 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 AC008752.2-201ENST00000591174 750 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 Six3os1_1.1-201ENST00000620900 87 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 AC034229.6-201ENST00000623704 224 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 AC006453.3-201ENST00000635891 377 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 VPS13A-202ENST00000357409 9967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 KCNMB3P1-202ENST00000493696 3389 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 AC107980.1-201ENST00000558671 3355 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 DNAH10-210ENST00000638045 13678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 AC020658.2-201ENST00000559030 4020 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 MAGT1-204ENST00000610432 4019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 RGS5-215ENST00000439699 1441 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 KCNIP4-201ENST00000359001 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 SP110-201ENST00000258381 2426 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 TRDMT1-210ENST00000488990 1301 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 TCEANC2-201ENST00000234827 10436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 ACKR2-201ENST00000422265 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 CYP2C8-212ENST00000623108 1962 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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AP3M2P53677 NRXN3-207ENST00000554719 4156 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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AP3M2P53677 ADGRL3-207ENST00000507625 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 AL021877.2-201ENST00000624442 10684 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 SORBS1-219ENST00000607232 4374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 NDFIP2-203ENST00000487865 1384 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 SLAMF1-202ENST00000302035 4006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 CR1-204ENST00000367052 7469 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 CR1-205ENST00000367053 7469 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 NUP93-202ENST00000542526 8257 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 SEPT14-201ENST00000388975 3785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 CEP97-206ENST00000494050 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 OR10D1P-201ENST00000355343 936 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 MIR99A-201ENST00000384906 81 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 TRAV12-3-201ENST00000390442 399 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 ATP5E-203ENST00000395663 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 AC019130.1-201ENST00000413841 391 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 MEG8-201ENST00000414488 800 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 NPIPB5-205ENST00000424340 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 LAPTM4BP1-201ENST00000447781 690 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 GOT2P2-201ENST00000450663 1251 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 NMNAT1P3-201ENST00000457517 888 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 RN7SL379P-201ENST00000479912 293 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 RN7SL849P-201ENST00000485236 295 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 RPL10P7-201ENST00000495649 625 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 IGHVII-51-2-201ENST00000519778 259 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 NQO1-205ENST00000561500 891 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 AC018767.3-201ENST00000564185 481 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 SNORA70D-201ENST00000578836 135 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 RN7SL426P-201ENST00000579106 295 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 ZNF431-203ENST00000594425 610 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 ZNF415-218ENST00000599261 601 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 AL512430.4-201ENST00000603085 613 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 AL121985.3-201ENST00000620690 523 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 AP003108.4-201ENST00000623917 878 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 AC006387.1-201ENST00000626365 671 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 AL049541.1-201ENST00000630976 642 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 NBPF26-206ENST00000617913 2931 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 LRRC31-202ENST00000316428 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
AP3M2P53677 SGCD-202ENST00000435422 9755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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