Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 ELMO1-202ENST00000396040 1982 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 PARP4-201ENST00000381989 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 ZNF816-203ENST00000357666 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 C2orf71-201ENST00000331664 7044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 DPF3-203ENST00000541685 4077 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 MYO15A-201ENST00000205890 11863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 MYO15A-217ENST00000615845 11860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 KIAA1671-203ENST00000406486 7864 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 SLC9A6-207ENST00000636092 4697 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 C5orf24-201ENST00000338051 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 MYOCD-201ENST00000343344 2817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 MTND2P12-201ENST00000417560 1252 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 GAPDHP57-201ENST00000424400 585 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 MEF2AP1-201ENST00000454867 863 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 AC096922.1-201ENST00000461635 651 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 AP002498.1-201ENST00000530190 568 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 NXPE2P1-201ENST00000543705 726 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 AL445383.1-201ENST00000554689 874 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 MT1B-202ENST00000562399 351 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 AC004801.6-201ENST00000616571 978 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 MIGA1-202ENST00000443751 6409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 MAPK10-379ENST00000642013 1385 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 AC005702.3-201ENST00000585345 1447 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 KIF11-201ENST00000260731 4860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 TMEM138-209ENST00000542946 2839 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 HSPD1P4-201ENST00000547203 1702 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 ATP2C1-208ENST00000504948 4714 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 XRCC6P4-201ENST00000518193 2067 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 FAM107A-202ENST00000394481 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 PCSK1-201ENST00000311106 5086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 PKP4-AS1-201ENST00000342892 4067 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 PCDHA10-203ENST00000562220 12358 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 MTAP-201ENST00000380172 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 LINC01910-201ENST00000582251 2637 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 CS-201ENST00000351328 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
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PTPRMP28827 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
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PTPRMP28827 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
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PTPRMP28827 SLC3A1-206ENST00000409740 1418 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 KIF15-201ENST00000326047 4842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 SLC26A5-205ENST00000393723 2174 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
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PTPRMP28827 CCNB3-204ENST00000376042 4693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
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PTPRMP28827 AC010886.1-201ENST00000437380 2869 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
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PTPRMP28827 CRBN-201ENST00000231948 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 VN2R1P-201ENST00000449668 1743 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 OR52K3P-202ENST00000641797 1729 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 MTMR10-201ENST00000435680 4961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 MAP7D3-204ENST00000370663 4446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
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PTPRMP28827 CYFIP2-221ENST00000618329 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 DHFRP2-201ENST00000414224 547 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 PMS2P3-203ENST00000422064 567 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 RBMY3AP-201ENST00000449381 1145 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 TVP23CP1-201ENST00000450317 639 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 AC083806.1-201ENST00000468934 316 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
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