Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 OR1N2-201ENST00000373688 1103 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 AC109638.1-201ENST00000417406 326 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 RPL36P18-201ENST00000419316 318 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 AC023141.1-201ENST00000419418 379 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 AC105052.2-201ENST00000434317 794 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 C5orf24-203ENST00000435259 851 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 AL133215.1-201ENST00000447344 342 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 CEACAMP3-202ENST00000483806 638 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 AC079594.1-201ENST00000489757 331 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 RN7SL445P-201ENST00000495609 293 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 C4orf19-203ENST00000508175 828 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 ROPN1B-207ENST00000511082 782 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 EIF3KP1-201ENST00000513279 656 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 AC226119.1-201ENST00000514073 682 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 OR5M4P-201ENST00000529436 925 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 SCIMP-204ENST00000574297 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 AC138207.8-206ENST00000580053 637 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 Metazoa_SRP.57-201ENST00000597717 283 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 IFNA5-201ENST00000610521 987 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 GLYATL1-219ENST00000612196 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 AC087893.2-201ENST00000623272 255 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 LINC01427-203ENST00000635277 781 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 AC011471.4-201ENST00000638271 216 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 OR10G8-202ENST00000641224 1033 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 ZMAT1-206ENST00000540921 3139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 WDR93-204ENST00000558000 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 AC105114.1-201ENST00000624795 1862 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 LIMA1-202ENST00000394943 3669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 CLEC5A-206ENST00000546910 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 AC007938.1-201ENST00000562524 2902 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 FAM208A-210ENST00000614531 3441 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 NFIB-221ENST00000637742 2166 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 ABLIM1-207ENST00000392955 7408 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 GPR1-203ENST00000437420 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 ZMYND11-204ENST00000381604 4066 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 CYP2G2P-201ENST00000594920 1485 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 SYTL2-220ENST00000529581 1910 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 RSC1A1-201ENST00000345034 1854 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 RNGTT-203ENST00000538899 1374 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 MAPK10-379ENST00000642013 1385 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 NAT1-210ENST00000545197 1827 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 RNU4-81P-201ENST00000363561 144 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 SERPINB12-202ENST00000382768 1278 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 LINC01687-201ENST00000416327 795 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 PPIL1P1-201ENST00000423936 499 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 LINC00390-201ENST00000432331 340 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 AC016396.1-201ENST00000440189 328 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 AL391422.2-202ENST00000454396 347 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 BZW1P1-201ENST00000454901 1240 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 SCARNA6-201ENST00000515982 265 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 DACT3-AS1-202ENST00000525008 496 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 AC055860.1-201ENST00000525523 688 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 AC104009.1-201ENST00000528009 635 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 ACRV1-203ENST00000530048 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 AC090673.2-201ENST00000544279 454 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 INO80-AS1-202ENST00000560178 444 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 AC090181.1-201ENST00000560446 264 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 C16orf62-224ENST00000567245 573 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 MIR5705-201ENST00000579870 89 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 AC015818.6-201ENST00000584274 634 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 LINC01396-201ENST00000609099 527 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 FAM13A-AS1_2.1-201ENST00000611121 108 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 AC061709.1-202ENST00000615029 527 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 MIR6807-201ENST00000621968 92 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 EDRF1-AS1-214ENST00000622798 526 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 LINC00682-204ENST00000637677 931 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 PAICS-208ENST00000514888 3340 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 ERICH3-202ENST00000420661 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 EOGT-201ENST00000295571 4138 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 FRMD5-211ENST00000618556 5059 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 GRPR-201ENST00000380289 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 ZNF600-201ENST00000338230 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 AC083806.2-201ENST00000617795 2685 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 VTCN1-203ENST00000369458 2612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 TRG-AS1-201ENST00000629357 3645 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 RGS5-215ENST00000439699 1441 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 DTHD1-206ENST00000639862 3819 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 CX3CR1-202ENST00000399220 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 ZNF761-202ENST00000432094 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 AC107067.1-201ENST00000500009 1654 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 AC129502.1-201ENST00000623261 1654 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 KLHL5-205ENST00000508137 2926 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 AC100858.3-201ENST00000533516 1605 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 AC079949.2-201ENST00000617117 2933 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 MXI1-204ENST00000369612 879 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SCN2BO60939 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
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