Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 RN7SKP254-201ENST00000410685 310 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 DLEU1-AS1-201ENST00000428276 731 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 GAPDHP37-201ENST00000442317 968 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 AC012158.1-202ENST00000482431 1132 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 NDUFB2-215ENST00000482954 544 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 AC008906.1-201ENST00000512856 993 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 AL359742.1-201ENST00000622497 540 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 ABLIM1-205ENST00000369266 2230 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 AC010132.4-201ENST00000569883 1368 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 GKN2-202ENST00000481498 1498 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 GDF9-202ENST00000378673 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 CELF2-203ENST00000416382 6894 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 NAV2-216ENST00000540292 11003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 EMX2OS-206ENST00000551288 7280 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 AC006141.1-201ENST00000581917 2170 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 SLC16A4-203ENST00000437429 2372 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 RBBP4-202ENST00000373493 7943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 KIAA0586-201ENST00000261244 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
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HOXD10P28358 TRPM3-212ENST00000396283 3484 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 PPM1L-205ENST00000498165 10934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
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HOXD10P28358 PAIP1-202ENST00000338972 1814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 CYP4A11-201ENST00000310638 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
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HOXD10P28358 BTN2A1-203ENST00000429381 3113 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 LRRC37A4P-201ENST00000579913 3243 ntTSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 SSR1-201ENST00000244763 9669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 RAG1-201ENST00000299440 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 XIRP2-202ENST00000409043 3292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 DOCK11-201ENST00000276202 6625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 IGLV5-52-201ENST00000390289 379 ntAPPRIS P1 BASIC8.03□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 AL590143.1-201ENST00000405071 138 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 RAC1P4-201ENST00000419413 579 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 OR6R1P-201ENST00000431838 940 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 AC006019.3-201ENST00000446335 698 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 LINC00349-201ENST00000448748 841 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 AC009948.1-203ENST00000450044 793 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
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HOXD10P28358 LNX1-202ENST00000306888 3757 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
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HOXD10P28358 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 RNA5SP188-201ENST00000362916 129 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 C2orf76-203ENST00000409523 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
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HOXD10P28358 AC006581.1-201ENST00000545706 496 ntTSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 AL356800.1-201ENST00000553339 735 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 GNG2-203ENST00000553432 577 ntTSL 4 BASIC8.02□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 PEX11A-205ENST00000561257 978 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 AC013640.1-201ENST00000565366 565 ntTSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 STRADA-207ENST00000578008 1153 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 AC006305.3-201ENST00000590589 454 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 LRMDA-216ENST00000611306 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 MALAT1-209ENST00000616691 587 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 PIK3AP1-203ENST00000371110 3151 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 ZNF674-207ENST00000523374 4073 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
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