Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 AC241584.2-201ENST00000637142 2090 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HDAC11Q96DB2 ANGEL2-201ENST00000360506 4323 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HDAC11Q96DB2 ERVFRD-1-201ENST00000472091 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HDAC11Q96DB2 B3GNT2-202ENST00000405767 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HDAC11Q96DB2 TCF4-278ENST00000636400 8343 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HDAC11Q96DB2 SALL4P7-201ENST00000555779 3120 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HDAC11Q96DB2 MAPK10-380ENST00000642015 3137 ntAPPRIS P2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HDAC11Q96DB2 RNU4-81P-201ENST00000363561 144 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HDAC11Q96DB2 SERPINB12-202ENST00000382768 1278 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HDAC11Q96DB2 AC023469.1-201ENST00000409243 469 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HDAC11Q96DB2 RNA5SP177-201ENST00000410122 107 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HDAC11Q96DB2 VN1R66P-201ENST00000412929 916 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HDAC11Q96DB2 MTND6P1-201ENST00000417434 424 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HDAC11Q96DB2 HMGN1P6-201ENST00000438508 291 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HDAC11Q96DB2 PA2G4P1-201ENST00000442248 1197 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HDAC11Q96DB2 DBIL5P2-201ENST00000443827 253 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HDAC11Q96DB2 AL138921.1-201ENST00000444359 846 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HDAC11Q96DB2 RPL21P33-201ENST00000444831 484 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HDAC11Q96DB2 AL034399.1-201ENST00000451535 380 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HDAC11Q96DB2 AC110772.1-201ENST00000503037 474 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HDAC11Q96DB2 AC111000.1-201ENST00000514545 713 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HDAC11Q96DB2 TPT1-AS1-213ENST00000521336 759 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HDAC11Q96DB2 AC090241.1-201ENST00000587732 621 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HDAC11Q96DB2 ZNF431-206ENST00000599296 586 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HDAC11Q96DB2 AL391425.1-201ENST00000613658 807 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HDAC11Q96DB2 AC244100.4-201ENST00000617747 388 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HDAC11Q96DB2 AL160408.3-201ENST00000442382 3564 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HDAC11Q96DB2 AC079178.2-201ENST00000439323 1624 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HDAC11Q96DB2 AC020978.6-201ENST00000571197 3177 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HDAC11Q96DB2 FHL1-227ENST00000628568 2304 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HDAC11Q96DB2 NIN-204ENST00000382043 4216 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HDAC11Q96DB2 MORC3-201ENST00000400485 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HDAC11Q96DB2 CDH18-205ENST00000506372 2432 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HDAC11Q96DB2 MSH6-209ENST00000538136 4055 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HDAC11Q96DB2 FMN1-211ENST00000561249 4251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HDAC11Q96DB2 TGFB2-202ENST00000366930 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HDAC11Q96DB2 AL355488.1-201ENST00000449169 2611 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HDAC11Q96DB2 LDB2-216ENST00000515064 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HDAC11Q96DB2 AL355306.2-202ENST00000634380 2281 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HDAC11Q96DB2 AC092821.2-201ENST00000545710 2042 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HDAC11Q96DB2 ARNT-201ENST00000354396 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HDAC11Q96DB2 LDHA-206ENST00000430553 1310 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HDAC11Q96DB2 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HDAC11Q96DB2 ZMYND11-204ENST00000381604 4066 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HDAC11Q96DB2 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HDAC11Q96DB2 LRMP-204ENST00000547044 2208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HDAC11Q96DB2 RAI14-228ENST00000515799 3486 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HDAC11Q96DB2 SEC31A-207ENST00000443462 4042 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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HDAC11Q96DB2 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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HDAC11Q96DB2 AC244100.2-202ENST00000612584 3878 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HDAC11Q96DB2 ADH7-202ENST00000437033 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HDAC11Q96DB2 AP003066.1-201ENST00000527528 1647 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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HDAC11Q96DB2 AC009500.1-201ENST00000420684 583 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HDAC11Q96DB2 DLEU1-AS1-201ENST00000428276 731 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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HDAC11Q96DB2 AP005328.2-201ENST00000606879 657 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HDAC11Q96DB2 AC127071.1-201ENST00000624997 712 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HDAC11Q96DB2 TSHZ2-205ENST00000626626 670 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HDAC11Q96DB2 AC110079.2-202ENST00000629093 698 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HDAC11Q96DB2 AC183089.2-201ENST00000637931 916 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HDAC11Q96DB2 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HDAC11Q96DB2 TCF7L2-220ENST00000543371 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HDAC11Q96DB2 AC009237.3-203ENST00000442128 3551 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HDAC11Q96DB2 NR1H5P-201ENST00000452683 1377 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HDAC11Q96DB2 EEF1A1P20-201ENST00000514852 1386 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HDAC11Q96DB2 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HDAC11Q96DB2 PHF11-201ENST00000357596 1471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HDAC11Q96DB2 IFT74-202ENST00000429045 1462 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HDAC11Q96DB2 ARF4-209ENST00000496292 1467 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HDAC11Q96DB2 LINC01990-201ENST00000609293 1487 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HDAC11Q96DB2 ZMYND11-216ENST00000602682 1687 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HDAC11Q96DB2 PRRC1-204ENST00000512635 2726 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HDAC11Q96DB2 ENTPD5-207ENST00000557325 3096 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 KIF18A-201ENST00000263181 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 RSAD2-201ENST00000382040 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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