Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AL136452.1-201ENST00000448495 439 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC013439.1-201ENST00000449965 1239 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AL357037.1-201ENST00000454758 322 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC239804.1-201ENST00000466343 869 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 RN7SL563P-201ENST00000481233 298 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AL355076.1-201ENST00000484315 270 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 RN7SL314P-201ENST00000490735 292 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 PPP4R2-207ENST00000495566 559 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AL449212.1-201ENST00000499853 517 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC109439.2-201ENST00000502421 564 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 LEF1-AS1-206ENST00000512129 430 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 IGHV7-40-201ENST00000520963 296 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 CA1-219ENST00000523022 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 KCTD21-AS1-204ENST00000528468 554 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AL136088.1-201ENST00000531002 541 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 SDHCP4-201ENST00000532834 510 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 PSMC1P8-201ENST00000536820 1296 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 PFDN5-211ENST00000550846 392 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 PFDN5-214ENST00000551018 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 SRMP2-201ENST00000553832 916 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 OR1P1-201ENST00000571766 994 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 MIR3689F-201ENST00000579617 66 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC008635.1-201ENST00000600716 562 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC087623.4-201ENST00000606593 695 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC016405.2-201ENST00000607393 312 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC073529.1-202ENST00000608576 1080 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 RN7SL3-201ENST00000610674 299 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 MALAT1-208ENST00000616527 572 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC243830.3-201ENST00000616810 376 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 BX005195.1-201ENST00000618097 1198 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 PPP3R2-202ENST00000636434 1081 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 Metazoa_SRP.212-201ENST00000636778 248 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC025287.4-201ENST00000640173 1240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC116535.1-201ENST00000499765 2335 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 ZNF540-206ENST00000589117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 CDH17-202ENST00000441892 2204 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 GAPVD1-207ENST00000394105 5207 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 RPS29-202ENST00000396020 7062 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 THADA-204ENST00000403856 6939 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 A2M-201ENST00000318602 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 RAPGEF5-201ENST00000344041 6621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC005840.3-201ENST00000541888 1803 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 NLRC4-204ENST00000404025 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 GAPVD1-201ENST00000265956 2667 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 DDX43P1-201ENST00000510713 1763 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 OR9Q1-201ENST00000335397 2488 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 GPD2-203ENST00000409674 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 ITPR1-202ENST00000354582 10242 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 SLFN12L-201ENST00000260908 3119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 POLA1-201ENST00000379059 5440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 POLA1-206ENST00000611764 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 NDFIP2-206ENST00000620924 2324 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 MYO6-201ENST00000369975 5387 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 MTFR2-205ENST00000451457 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 ZNF430-203ENST00000595401 3021 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 MFSD8-243ENST00000641695 1455 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 ACKR2-202ENST00000442925 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 ZNF887P-201ENST00000431363 1407 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 IRAK4-201ENST00000431837 4147 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 CACNA1D-224ENST00000637424 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 PARP9-202ENST00000462315 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 ZNF567-204ENST00000588311 2042 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 FHL1-230ENST00000630084 1335 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 KRBOX1-202ENST00000418176 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 SNORA71D-201ENST00000363484 134 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AL450124.1-201ENST00000376401 353 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 H2AFZP3-201ENST00000394213 387 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AL513164.1-201ENST00000423268 311 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 OR5AC1-201ENST00000429239 925 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 EMC3-AS1-204ENST00000430621 683 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 PSMD8P1-201ENST00000436275 769 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 ST13P2-201ENST00000438916 1109 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 MAGEC3-203ENST00000443323 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC074257.1-201ENST00000446340 585 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 EIF2S2P2-201ENST00000447161 982 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 EIPR1-IT1-201ENST00000454977 718 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 UCK2-206ENST00000470820 1083 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
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