Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AC114812.2-201ENST00000439336 663 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
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COL4A6Q14031 COL25A1-208ENST00000610288 4799 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
COL4A6Q14031 FRMPD2-213ENST00000636244 4194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
COL4A6Q14031 KIAA1671-206ENST00000637069 6510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
COL4A6Q14031 RNF139-AS1-201ENST00000499418 5654 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
COL4A6Q14031 CCNB3-204ENST00000376042 4693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
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