Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 DCP1B-205ENST00000540622 1547 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 MYCBP2-212ENST00000612956 1542 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 ZNF253-201ENST00000355650 2268 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 ARF4-209ENST00000496292 1467 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 C15orf41-214ENST00000569302 1325 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 TAS2R7-201ENST00000240687 1096 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP71-201ENST00000362967 126 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 SVBP-201ENST00000372521 658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 MRPS33-202ENST00000393008 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 TPRG1-AS2-201ENST00000425454 479 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 AC073900.1-201ENST00000429766 776 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 CDH13-203ENST00000431540 831 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 AL607028.1-201ENST00000433455 794 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 AC245047.6-201ENST00000445444 617 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 AL035420.1-202ENST00000450129 357 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 AC022730.2-201ENST00000465359 452 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 AC096743.1-201ENST00000485172 319 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 H3F3AP3-201ENST00000497682 407 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 AC117422.1-201ENST00000508263 379 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 AC011726.3-201ENST00000518031 568 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 AC091182.2-201ENST00000520431 578 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 AC084337.1-201ENST00000524809 686 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 AL161757.4-202ENST00000557467 737 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 AC073657.1-202ENST00000562063 334 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 CDH13-207ENST00000565636 810 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 AL390058.1-201ENST00000603834 629 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 OR13Z2P-201ENST00000606338 555 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 AL080250.1-202ENST00000607221 915 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 AC006335.3-201ENST00000613408 292 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 AC120057.5-201ENST00000623840 154 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 AL392046.2-202ENST00000635301 1113 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 AL136317.2-201ENST00000619851 2254 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 CCR3-202ENST00000395940 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 DIO2-AS1-201ENST00000553979 1597 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 LINC01991-202ENST00000446091 1524 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 CSNK2A1-204ENST00000400227 1499 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 AC125793.1-201ENST00000565238 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 COPS3-203ENST00000439936 1394 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 DOCK11-201ENST00000276202 6625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 SNORA73B-201ENST00000363217 204 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 XAGE5-202ENST00000375501 415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 SOX9-AS1-202ENST00000414600 742 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 AC231533.2-201ENST00000419045 978 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 AL513329.1-201ENST00000426575 657 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 LINC01049-201ENST00000426840 742 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 BRWD1-IT1-201ENST00000435608 489 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 LINC01591-202ENST00000522279 1240 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 AC013546.1-201ENST00000523232 564 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 AC069360.1-202ENST00000533941 557 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 AC156455.1-201ENST00000538790 851 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 AC140118.1-201ENST00000539209 532 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 LRMDA-216ENST00000611306 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 PFN1P2-202ENST00000621347 397 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 AC005785.2-201ENST00000624655 631 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 CR589904.1-203ENST00000636515 318 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 ATP9B-208ENST00000586722 1650 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 BPIFC-203ENST00000397452 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 RNF146-215ENST00000616343 2077 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 AP002370.1-201ENST00000528055 1602 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 LINC01011-204ENST00000605901 1573 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 SLC26A7-202ENST00000309536 2656 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 AC013562.1-201ENST00000519427 1722 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 PARP4P1-201ENST00000435945 2337 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 FKBP5-202ENST00000536438 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 RASGRF1-201ENST00000394745 2850 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 TRAV19-201ENST00000390447 467 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 SRSF7-202ENST00000409276 1050 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 AC099560.1-201ENST00000412811 500 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 AL109935.1-201ENST00000413249 473 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 GAPDHP46-201ENST00000424043 994 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 AC146944.2-202ENST00000425529 658 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 AL445218.1-202ENST00000427695 845 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 AC074257.1-201ENST00000446340 585 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 AC016683.1-201ENST00000446590 559 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 LYPD6B-207ENST00000450639 484 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 TUBB4BP2-201ENST00000454125 798 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 AL590648.1-201ENST00000456479 460 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
IFFO1Q0D2I5 OR7E62P-201ENST00000456741 477 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
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