Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 LYPD6B-207ENST00000450639 484 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 AC026254.1-201ENST00000479473 431 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 AC140125.3-202ENST00000504362 348 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 AC138965.1-201ENST00000509329 348 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 IGLV1-62-201ENST00000518003 441 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 AC103409.1-201ENST00000521199 564 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 CRYAB-203ENST00000525823 915 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 WASF2-201ENST00000536657 1083 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 COPZ1-205ENST00000548753 778 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 COPZ1-218ENST00000553231 551 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 HNRNPC-226ENST00000556628 1156 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 AC073657.1-202ENST00000562063 334 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 AC243312.1-201ENST00000570582 275 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 AC130324.2-201ENST00000580873 638 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 AC114488.2-208ENST00000591592 578 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 AL390058.1-201ENST00000603834 629 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 AL136141.1-201ENST00000605780 369 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 AL132821.1-201ENST00000616029 394 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 LINC01742-201ENST00000616333 628 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 MIR7848-201ENST00000617402 101 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 EFCAB8-204ENST00000618684 435 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 Metazoa_SRP.42-201ENST00000621081 348 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 AC127071.1-201ENST00000624997 712 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 LRMP-204ENST00000547044 2208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 CPB1-201ENST00000282957 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 TCF4-225ENST00000564999 3590 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 ZNF639-201ENST00000326361 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 ZNF532-223ENST00000591230 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 AC106038.1-201ENST00000501194 3473 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 KCNJ10-207ENST00000638868 3883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 AC125232.1-201ENST00000452554 1408 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 ALS2CR12-207ENST00000439709 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 CBWD6-203ENST00000456520 1608 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 DDX10P2-201ENST00000417796 2614 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 ATAD1-202ENST00000328142 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 ARHGAP32-202ENST00000392657 6556 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 CDC73-204ENST00000635846 3987 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 SLC22A25-201ENST00000306494 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 AC007485.2-201ENST00000623493 1667 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 CCR3-202ENST00000395940 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 EEF1A1P22-201ENST00000559385 1380 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 ARL17A-202ENST00000336125 3945 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 SGMS1-201ENST00000361543 1096 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 RFPL3S-201ENST00000382084 1117 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 AL355862.1-201ENST00000412705 353 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 AC231533.2-201ENST00000419045 978 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 AC007679.2-201ENST00000422116 781 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 ATP5G1P5-201ENST00000429024 411 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 AL606752.1-201ENST00000435442 666 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 LYSMD1-202ENST00000440902 1003 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 RN7SL149P-201ENST00000465197 281 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 LINC02010-201ENST00000470860 516 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 AC025180.1-201ENST00000505701 595 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 LINC01098-201ENST00000507870 1034 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 AC097494.1-201ENST00000512898 732 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 LINC01288-201ENST00000519189 529 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 IGLV10-67-201ENST00000519446 325 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 AP003548.1-201ENST00000523862 711 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 AP000873.4-201ENST00000528133 905 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 OR4N3P-201ENST00000559395 818 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 AC012291.1-201ENST00000559666 429 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 AC010618.3-203ENST00000595116 313 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 AC010320.1-201ENST00000599775 578 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 AL953862.2-201ENST00000603089 820 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 AC211486.5-201ENST00000616609 775 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 MIR6723-201ENST00000621981 89 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 AC135068.4-201ENST00000622949 925 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 AP003068.4-201ENST00000623192 802 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 GAS2-210ENST00000630668 674 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 MEF2C-201ENST00000340208 6192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 KIAA0753-207ENST00000572370 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 TRDMT1-210ENST00000488990 1301 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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