Protein–RNA interactions for Protein: P62306

SNRPF, Small nuclear ribonucleoprotein F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPFP62306 MIR4435-2HG-219ENST00000609220 883 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 Six3os1_1.1-201ENST00000620900 87 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 AC131009.3-201ENST00000621809 287 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 AC005753.1-201ENST00000623837 618 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 JAKMIP2-AS1-202ENST00000627433 831 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 DLG2-209ENST00000418306 3027 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 TEX14-203ENST00000389934 4927 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 OGFOD1P1-201ENST00000447552 1592 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 CHORDC1-201ENST00000320585 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 NCOA4P3-201ENST00000513203 1877 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 CTPS1-201ENST00000372616 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 AC133485.2-201ENST00000566232 2484 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 ABCD3-202ENST00000370214 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 MAPK10-379ENST00000642013 1385 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 SLC22A25-201ENST00000306494 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 ELMO1-202ENST00000396040 1982 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 DLC1-215ENST00000520226 3556 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 ZNF519-207ENST00000590202 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 DPCR1-201ENST00000304311 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 SOX6-208ENST00000527619 2699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 TGFBR3-202ENST00000370399 4550 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 LINC01559-201ENST00000318426 2750 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 ASB8-201ENST00000317697 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 SPATA31C2-201ENST00000324915 3777 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 GSTCD-201ENST00000360505 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 SERPINB8-208ENST00000542677 3192 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 RAB5B-201ENST00000360299 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 FBXO43-201ENST00000428847 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 NXF2B-204ENST00000618302 2884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 SLC39A12-202ENST00000377371 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 AC009237.3-203ENST00000442128 3551 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 CYB5B-201ENST00000307892 4286 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 SIPA1L1-201ENST00000358550 6539 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 RAET1L-201ENST00000286380 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 OR10D1P-201ENST00000355343 936 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 TRAV5-201ENST00000390427 352 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 AL139135.1-201ENST00000412675 209 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 NUCB1-AS1-201ENST00000416432 433 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 MICG-208ENST00000416822 132 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 ETDB-201ENST00000423661 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 ETDB-202ENST00000426364 388 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 KCND3-AS1-202ENST00000427471 583 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 ETDA-201ENST00000427686 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 PUDPP2-201ENST00000431423 643 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 ETDA-202ENST00000454551 388 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 BZW1P1-201ENST00000454901 1240 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 AC021146.11-201ENST00000503319 491 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 AC018953.1-201ENST00000523265 730 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 LINC01559-203ENST00000531049 683 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 LRTOMT-217ENST00000539587 428 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 AL135978.1-201ENST00000553618 1266 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 AC126323.4-201ENST00000566935 234 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 RN7SL689P-201ENST00000577215 297 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 AC020914.7-201ENST00000594477 545 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 AL353807.4-201ENST00000604995 257 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 AC103564.3-201ENST00000621194 220 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 LINC01141-204ENST00000635564 1008 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 LINC01252-201ENST00000499291 3673 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 HMGCR-209ENST00000511206 3395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 ETV1-201ENST00000242066 6348 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 HMGB4-204ENST00000522796 2505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 AC034111.1-201ENST00000562143 3770 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 MAPK10-251ENST00000640858 3052 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 MGAM-208ENST00000549489 6525 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 SETDB1-201ENST00000271640 4437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 ZNF23-204ENST00000428724 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 BLOC1S2-206ENST00000618916 2470 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 MAPK10-380ENST00000642015 3137 ntAPPRIS P2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 ZNF532-223ENST00000591230 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 ZFX-201ENST00000304543 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 EPS8-213ENST00000543612 2965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 CLNK-204ENST00000515667 4180 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 CRNKL1-207ENST00000536226 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 STAMBPL1-201ENST00000371922 1899 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 TRIM5-203ENST00000396847 3170 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 APOL4-212ENST00000616056 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 FCGR1B-210ENST00000623603 1581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 CABYR-216ENST00000621648 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 BMPR1B-201ENST00000264568 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 DLC1-202ENST00000316609 1837 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 GATAD2B-204ENST00000634544 2342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 DDX58-202ENST00000379883 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 SLC35A3-207ENST00000533028 14759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 WDR48-201ENST00000302313 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 IFT74-204ENST00000443698 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 ARHGEF3-214ENST00000497267 2197 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 AL160408.3-201ENST00000442382 3564 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 ZNF131-201ENST00000306938 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 GMFG-201ENST00000253054 616 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 MIR99A-201ENST00000384906 81 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 IL20-203ENST00000391930 1153 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 DNASE1L3-201ENST00000394549 1294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 ATP5J-206ENST00000400099 492 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 MIR541-201ENST00000401360 84 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 UGT1A6-203ENST00000406651 785 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 RPL31-202ENST00000409000 641 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 AL713923.1-201ENST00000414071 378 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 SNX19-202ENST00000426933 888 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNRPFP62306 PHB2P1-201ENST00000434943 890 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
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