Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AL139039.3-201ENST00000413129 1475 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 NF1P8-201ENST00000415351 1461 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 RSF1-201ENST00000308488 11550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 LRAT-206ENST00000507827 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 MLLT3-203ENST00000380338 6772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 SYNE1-213ENST00000448038 6001 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 SLC35A3-207ENST00000533028 14759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 NLRP9-201ENST00000332836 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 KDM4C-205ENST00000428870 3039 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 MPPED2-201ENST00000358117 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 STAG1-202ENST00000383202 6055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 LINC02511-201ENST00000505736 1668 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 CCDC77-210ENST00000540180 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 SPATA31A1-201ENST00000377647 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 SPATA31A7-206ENST00000619167 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 EEF1A1P26-201ENST00000458319 1363 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 CDHR3-201ENST00000317716 3813 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 PDGFC-203ENST00000502773 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 WDR44-202ENST00000371822 3877 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 OR4Q3-202ENST00000642117 2165 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 ITSN1-206ENST00000381318 17015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC026398.1-201ENST00000413683 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 VEPH1-201ENST00000362010 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 HMBOX1-211ENST00000524238 1731 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 TP63-207ENST00000418709 2810 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC242022.1-201ENST00000638002 1565 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 NUFIP1-201ENST00000379161 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 PWRN1-211ENST00000568609 1443 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 NUSAP1-210ENST00000560177 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 SLC11A2-201ENST00000262051 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 CDC40-201ENST00000307731 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 RPL24P4-201ENST00000326586 421 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 EPGN-201ENST00000332112 847 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 UBE2D3-204ENST00000349311 838 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 CASP10-206ENST00000374650 1126 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 CFAP61-203ENST00000377293 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 OR6C1-201ENST00000379668 1064 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 CD209-205ENST00000394161 507 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
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USP18Q9UMW8 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
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USP18Q9UMW8 AP001007.2-201ENST00000525429 593 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
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USP18Q9UMW8 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
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USP18Q9UMW8 C1S-205ENST00000406697 3076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
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USP18Q9UMW8 CYP19A1-216ENST00000559878 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 CENPJ-201ENST00000381884 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 HEATR1-202ENST00000366581 6538 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 ENSA-204ENST00000356527 2546 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 MS4A7-202ENST00000358246 2871 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 XIST-206ENST00000434839 2865 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 SERPINA6-201ENST00000341584 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 VEZF1P1-201ENST00000423931 1541 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 RND3-201ENST00000263895 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 C11orf88-203ENST00000529167 3099 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC093844.1-201ENST00000514910 1361 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC090774.4-201ENST00000578888 1372 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 MKKS-201ENST00000347364 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 ATP2B4-204ENST00000367218 8918 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 LINC00184-201ENST00000429269 2270 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 ANK2-212ENST00000506722 8051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 FAM83B-201ENST00000306858 3167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AL353898.3-201ENST00000624679 1755 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 OSBPL9-202ENST00000371714 3352 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 ANK2-203ENST00000394537 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC7.72□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 GABARAPL3-201ENST00000412799 354 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC231533.2-201ENST00000419045 978 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
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