Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 OAT-201ENST00000368845 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 TMEM59-204ENST00000371344 2473 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 CEP128-209ENST00000555265 4662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 PSG5-202ENST00000366175 1766 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 LINC00964-202ENST00000510897 3534 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 HM13-224ENST00000498035 3932 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 FAM217B-201ENST00000358293 5152 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 GSTO2-202ENST00000369707 6423 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 SLC10A7-201ENST00000335472 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 TINAG-202ENST00000370864 692 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 AL807757.2-201ENST00000416455 779 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 AC016766.1-201ENST00000429636 714 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 AC068888.2-201ENST00000435621 536 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 AC022296.2-201ENST00000512424 202 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 CSNK1A1-207ENST00000515768 1098 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 CLEC7A-208ENST00000525605 573 ntTSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 SNRPCP6-201ENST00000528310 210 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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PTPRMP28827 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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PTPRMP28827 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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PTPRMP28827 ARF4-209ENST00000496292 1467 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 WDR75-201ENST00000314761 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 CDH11-202ENST00000394156 6874 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 SVOP-205ENST00000610966 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 SIPA1L1-211ENST00000555818 7831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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PTPRMP28827 CEACAM5-203ENST00000405816 2354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 PRKG1-203ENST00000373980 6928 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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PTPRMP28827 RND3-201ENST00000263895 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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PTPRMP28827 TRERF1-204ENST00000372922 7286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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PTPRMP28827 PRDM10-207ENST00000528746 6182 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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PTPRMP28827 SLA-201ENST00000338087 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PTPRMP28827 LINC00517-202ENST00000554257 3460 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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