Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC126323.5-201ENST00000569913 592 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC009171.1-201ENST00000572673 266 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 MIR3714-201ENST00000579507 65 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 DSG1-AS1-204ENST00000581856 669 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 LINC00674-202ENST00000590734 160 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 SMIM11B-201ENST00000612624 1021 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AL669830.1-201ENST00000621457 656 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 RPS27L-208ENST00000635699 693 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 FAM47E-202ENST00000502320 6249 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 KRIT1-203ENST00000394505 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 MAPK10-233ENST00000515650 2394 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 DDX11L16-201ENST00000507418 1306 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 CD163-203ENST00000432237 3701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 ABCA6-201ENST00000284425 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC025040.2-201ENST00000558657 1852 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 BBX-207ENST00000416476 2178 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 PRDM2-201ENST00000235372 7957 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 IL1RL1-203ENST00000404917 3571 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 ADGRF2-204ENST00000507065 3043 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 CYSLTR2-202ENST00000614739 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 MAPK10-377ENST00000642006 2752 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 FANCL-201ENST00000233741 1683 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 FANCL-202ENST00000402135 1698 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC004862.1-209ENST00000437763 1678 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 ABCA9-201ENST00000340001 6514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC073324.1-201ENST00000425993 1435 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 TRIM49-202ENST00000532501 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC020549.1-201ENST00000536916 1440 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 PROM1-210ENST00000510224 4006 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 ITSN1-206ENST00000381318 17015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 TENM4-201ENST00000278550 14000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 MMADHC-202ENST00000422782 1462 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 KRT23-202ENST00000436344 1485 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 DNM1L-207ENST00000452533 4439 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 TBX5-202ENST00000349716 3585 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 ZBTB18-201ENST00000358704 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 DHX57-203ENST00000457308 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 COL21A1-212ENST00000535941 3369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 RUNDC3A-AS1-202ENST00000588097 5203 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 ALDOB-201ENST00000374855 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 ZNF559-ZNF177-202ENST00000446085 2470 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 SOD2-211ENST00000538183 14266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 SORBS1-219ENST00000607232 4374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 CTNNA1-201ENST00000302763 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 NADK2-201ENST00000282512 2507 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 OCM-201ENST00000242104 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 CARD17-201ENST00000375707 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 DYNLT3-202ENST00000378581 920 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 PDHA1-202ENST00000379804 709 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 GNAT3-201ENST00000398291 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AL080285.1-201ENST00000404225 984 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 RN7SKP26-201ENST00000410247 293 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 ECHDC1-207ENST00000430841 1009 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC098828.1-201ENST00000436164 440 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC098483.1-202ENST00000436515 967 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AL592182.2-201ENST00000442477 858 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC093581.1-204ENST00000442606 390 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 LINC01284-201ENST00000442994 730 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 DPP10-AS1-202ENST00000448663 644 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AL135929.1-201ENST00000449287 552 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC138089.1-201ENST00000450847 967 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 RARRES2P3-201ENST00000457739 473 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 RPSAP52-201ENST00000489520 1144 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 RN7SL416P-201ENST00000494042 298 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 GAPDHP38-201ENST00000503632 1002 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 CC2D2A-205ENST00000503658 605 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC107385.1-201ENST00000507985 778 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 POLB-211ENST00000521492 786 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AP000445.1-201ENST00000526692 741 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 STH-201ENST00000537309 445 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 LINC02407-202ENST00000553247 1083 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 FLJ21408-204ENST00000566854 601 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC024267.3-201ENST00000579673 562 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AP000919.1-202ENST00000581139 1264 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 LINC00663-206ENST00000589910 732 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
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