Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 CTPS1-201ENST00000372616 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 PC-201ENST00000393955 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 STK36-202ENST00000392105 4821 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 NCAM1-221ENST00000615112 5967 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 ZSCAN26-207ENST00000623276 1998 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 AL035555.1-201ENST00000404462 1790 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 AL353898.3-201ENST00000624679 1755 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 ASAH1-227ENST00000636455 1777 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 PLP1-221ENST00000619236 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 KBTBD4-201ENST00000395288 2460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 AL078645.2-201ENST00000245811 1325 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 C2CD3-202ENST00000334126 7960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 TRPV1-202ENST00000399756 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 SOX5-210ENST00000537393 2769 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 BTN3A2-204ENST00000396948 1494 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 ZNF780A-201ENST00000340963 3674 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 PKD1-203ENST00000423118 14135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 AC002451.2-201ENST00000624998 2398 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 RBP2-201ENST00000232217 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 RPS21-201ENST00000343986 344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 ZMYND8-203ENST00000352431 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 CYP17A1-AS1-201ENST00000369884 491 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 U3.17-201ENST00000390863 203 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 RNA5SP158-201ENST00000410298 102 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 RN7SKP85-201ENST00000411349 318 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 TRGVA-201ENST00000413819 285 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 AC092373.1-201ENST00000414951 490 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 RPSAP2-201ENST00000416785 888 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 AC022400.1-201ENST00000434147 445 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 AL359979.1-201ENST00000446145 487 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 EFCAB2-207ENST00000447569 527 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 LINC00307-201ENST00000451410 424 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 AL513542.1-201ENST00000452494 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 RPL7AP50-201ENST00000452821 795 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 RPL41-202ENST00000501597 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 AC233724.11-201ENST00000508480 404 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 AC021860.1-201ENST00000515436 376 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 AF279873.3-201ENST00000523063 766 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 ORMDL2-203ENST00000548974 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 AL355922.4-201ENST00000555642 449 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 AF111167.1-201ENST00000555909 704 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 AC092139.1-201ENST00000567149 497 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 MRPL45P2-203ENST00000573318 473 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
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PSEN1P49768 MIR7848-201ENST00000617402 101 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 RFPL3-AS1_1.2-201ENST00000618747 88 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 AC106774.9-201ENST00000638668 597 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 KIF9-AS1-201ENST00000429315 4898 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 LINC01226-208ENST00000640623 5019 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 RPL12P38-202ENST00000588627 2319 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 ERG-203ENST00000398905 4806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 ZSCAN32-201ENST00000304926 3027 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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PSEN1P49768 FBXW12-202ENST00000415155 1370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 MIGA1-201ENST00000370791 5288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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PSEN1P49768 RCAN1-204ENST00000399272 2164 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 SMAD2-205ENST00000586040 1971 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 ZNF184-201ENST00000211936 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 FSD1L-202ENST00000374710 7664 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 TRAK2-201ENST00000332624 6510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 ZSCAN9-201ENST00000252207 1621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 SLC9A6-213ENST00000637234 4691 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 ATP5G3-201ENST00000284727 5484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 KLHL7-AS1-201ENST00000419813 2564 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 INTS7-201ENST00000366992 3380 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 AC011294.1-202ENST00000451905 1947 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 KCNA2-211ENST00000639233 5256 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 S100A7A-201ENST00000329256 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 IGLV5-45-201ENST00000390296 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 VAMP8-202ENST00000409760 805 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 FAM180A-202ENST00000415751 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PSEN1P49768 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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