Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X2

PIAS3, E3 SUMO-protein ligase PIAS3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIAS3Q9Y6X2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PIAS3Q9Y6X2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms