Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP16Q9Y5T5 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP16Q9Y5T5 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP16Q9Y5T5 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP16Q9Y5T5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP16Q9Y5T5 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP16Q9Y5T5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP16Q9Y5T5 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP16Q9Y5T5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP16Q9Y5T5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP16Q9Y5T5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP16Q9Y5T5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP16Q9Y5T5 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP16Q9Y5T5 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP16Q9Y5T5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP16Q9Y5T5 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP16Q9Y5T5 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP16Q9Y5T5 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP16Q9Y5T5 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP16Q9Y5T5 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP16Q9Y5T5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP16Q9Y5T5 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP16Q9Y5T5 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP16Q9Y5T5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP16Q9Y5T5 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP16Q9Y5T5 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP16Q9Y5T5 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP16Q9Y5T5 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP16Q9Y5T5 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP16Q9Y5T5 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP16Q9Y5T5 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP16Q9Y5T5 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP16Q9Y5T5 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP16Q9Y5T5 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
USP16Q9Y5T5 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
USP16Q9Y5T5 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP16Q9Y5T5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms