Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C2

TCAF1, TRPM8 channel-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF1Q9Y4C2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TCAF1Q9Y4C2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms