Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

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Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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HCN4Q9Y3Q4 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
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HCN4Q9Y3Q4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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HCN4Q9Y3Q4 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
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HCN4Q9Y3Q4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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HCN4Q9Y3Q4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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HCN4Q9Y3Q4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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HCN4Q9Y3Q4 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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HCN4Q9Y3Q4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HCN4Q9Y3Q4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
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