Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms