Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms