Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NOP58Q9Y2X3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms