Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAN1Q9Y2M0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms