Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms