Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVW-1Q9UQF0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms