Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

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Length 1,477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NRXN1Q9ULB1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NRXN1Q9ULB1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NRXN1Q9ULB1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NRXN1Q9ULB1 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NRXN1Q9ULB1 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NRXN1Q9ULB1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NRXN1Q9ULB1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NRXN1Q9ULB1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NRXN1Q9ULB1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NRXN1Q9ULB1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NRXN1Q9ULB1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NRXN1Q9ULB1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NRXN1Q9ULB1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NRXN1Q9ULB1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NRXN1Q9ULB1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NRXN1Q9ULB1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NRXN1Q9ULB1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NRXN1Q9ULB1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NRXN1Q9ULB1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NRXN1Q9ULB1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NRXN1Q9ULB1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NRXN1Q9ULB1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NRXN1Q9ULB1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NRXN1Q9ULB1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NRXN1Q9ULB1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NRXN1Q9ULB1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NRXN1Q9ULB1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NRXN1Q9ULB1 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NRXN1Q9ULB1 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NRXN1Q9ULB1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NRXN1Q9ULB1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NRXN1Q9ULB1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NRXN1Q9ULB1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NRXN1Q9ULB1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NRXN1Q9ULB1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NRXN1Q9ULB1 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NRXN1Q9ULB1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NRXN1Q9ULB1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NRXN1Q9ULB1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NRXN1Q9ULB1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NRXN1Q9ULB1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NRXN1Q9ULB1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NRXN1Q9ULB1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NRXN1Q9ULB1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NRXN1Q9ULB1 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NRXN1Q9ULB1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NRXN1Q9ULB1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NRXN1Q9ULB1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NRXN1Q9ULB1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NRXN1Q9ULB1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NRXN1Q9ULB1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NRXN1Q9ULB1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
NRXN1Q9ULB1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
NRXN1Q9ULB1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
NRXN1Q9ULB1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NRXN1Q9ULB1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NRXN1Q9ULB1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NRXN1Q9ULB1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NRXN1Q9ULB1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
NRXN1Q9ULB1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NRXN1Q9ULB1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NRXN1Q9ULB1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NRXN1Q9ULB1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NRXN1Q9ULB1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NRXN1Q9ULB1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NRXN1Q9ULB1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NRXN1Q9ULB1 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NRXN1Q9ULB1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NRXN1Q9ULB1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NRXN1Q9ULB1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NRXN1Q9ULB1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NRXN1Q9ULB1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NRXN1Q9ULB1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NRXN1Q9ULB1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NRXN1Q9ULB1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NRXN1Q9ULB1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NRXN1Q9ULB1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NRXN1Q9ULB1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NRXN1Q9ULB1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NRXN1Q9ULB1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NRXN1Q9ULB1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NRXN1Q9ULB1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NRXN1Q9ULB1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NRXN1Q9ULB1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NRXN1Q9ULB1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NRXN1Q9ULB1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NRXN1Q9ULB1 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NRXN1Q9ULB1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NRXN1Q9ULB1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NRXN1Q9ULB1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NRXN1Q9ULB1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NRXN1Q9ULB1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NRXN1Q9ULB1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NRXN1Q9ULB1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NRXN1Q9ULB1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NRXN1Q9ULB1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
NRXN1Q9ULB1 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NRXN1Q9ULB1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
NRXN1Q9ULB1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
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