Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms