Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCNL1Q9UK58 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CCNL1Q9UK58 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCNL1Q9UK58 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCNL1Q9UK58 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCNL1Q9UK58 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCNL1Q9UK58 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCNL1Q9UK58 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCNL1Q9UK58 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms