Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms