Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPA4Q9UI42 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms