Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CNTNAP2Q9UHC6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CNTNAP2Q9UHC6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTNAP2Q9UHC6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTNAP2Q9UHC6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTNAP2Q9UHC6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTNAP2Q9UHC6 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTNAP2Q9UHC6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTNAP2Q9UHC6 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTNAP2Q9UHC6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms