Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLN8Q9UBY8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLN8Q9UBY8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLN8Q9UBY8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLN8Q9UBY8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLN8Q9UBY8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CLN8Q9UBY8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLN8Q9UBY8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLN8Q9UBY8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLN8Q9UBY8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CLN8Q9UBY8 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CLN8Q9UBY8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLN8Q9UBY8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLN8Q9UBY8 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLN8Q9UBY8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLN8Q9UBY8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLN8Q9UBY8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLN8Q9UBY8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLN8Q9UBY8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLN8Q9UBY8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLN8Q9UBY8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLN8Q9UBY8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLN8Q9UBY8 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLN8Q9UBY8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLN8Q9UBY8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLN8Q9UBY8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLN8Q9UBY8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLN8Q9UBY8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLN8Q9UBY8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CLN8Q9UBY8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLN8Q9UBY8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLN8Q9UBY8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLN8Q9UBY8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLN8Q9UBY8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLN8Q9UBY8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLN8Q9UBY8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLN8Q9UBY8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLN8Q9UBY8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLN8Q9UBY8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLN8Q9UBY8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLN8Q9UBY8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLN8Q9UBY8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLN8Q9UBY8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLN8Q9UBY8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLN8Q9UBY8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLN8Q9UBY8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLN8Q9UBY8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLN8Q9UBY8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLN8Q9UBY8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLN8Q9UBY8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLN8Q9UBY8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLN8Q9UBY8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLN8Q9UBY8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CLN8Q9UBY8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLN8Q9UBY8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLN8Q9UBY8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CLN8Q9UBY8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLN8Q9UBY8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLN8Q9UBY8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CLN8Q9UBY8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLN8Q9UBY8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLN8Q9UBY8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLN8Q9UBY8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLN8Q9UBY8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CLN8Q9UBY8 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CLN8Q9UBY8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms