Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TFIP11Q9UBB9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TFIP11Q9UBB9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TFIP11Q9UBB9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TFIP11Q9UBB9 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TFIP11Q9UBB9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TFIP11Q9UBB9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TFIP11Q9UBB9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TFIP11Q9UBB9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TFIP11Q9UBB9 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TFIP11Q9UBB9 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TFIP11Q9UBB9 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TFIP11Q9UBB9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TFIP11Q9UBB9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TFIP11Q9UBB9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TFIP11Q9UBB9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TFIP11Q9UBB9 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TFIP11Q9UBB9 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TFIP11Q9UBB9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFIP11Q9UBB9 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TFIP11Q9UBB9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFIP11Q9UBB9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFIP11Q9UBB9 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFIP11Q9UBB9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFIP11Q9UBB9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFIP11Q9UBB9 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFIP11Q9UBB9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFIP11Q9UBB9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFIP11Q9UBB9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFIP11Q9UBB9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFIP11Q9UBB9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TFIP11Q9UBB9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TFIP11Q9UBB9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFIP11Q9UBB9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFIP11Q9UBB9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TFIP11Q9UBB9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFIP11Q9UBB9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFIP11Q9UBB9 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFIP11Q9UBB9 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFIP11Q9UBB9 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFIP11Q9UBB9 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFIP11Q9UBB9 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFIP11Q9UBB9 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFIP11Q9UBB9 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFIP11Q9UBB9 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFIP11Q9UBB9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFIP11Q9UBB9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms