Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R7

SUCLA2, Succinate--CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLA2Q9P2R7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms