Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms