Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M7

CGN, Cingulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNQ9P2M7 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CGNQ9P2M7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms