Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PHRF1Q9P1Y6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms