Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms