Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
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