Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms