Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBM28Q9NW13 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms