Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms