Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms