Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VPS45Q9NRW7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VPS45Q9NRW7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
VPS45Q9NRW7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
VPS45Q9NRW7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VPS45Q9NRW7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VPS45Q9NRW7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
VPS45Q9NRW7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VPS45Q9NRW7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VPS45Q9NRW7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VPS45Q9NRW7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VPS45Q9NRW7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VPS45Q9NRW7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VPS45Q9NRW7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VPS45Q9NRW7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VPS45Q9NRW7 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms