Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms