Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms